Arq. Bras. Cardiol. 2024; 121(12): e20230674

Biomarcadores Potenciais na Fibrose Miocárdica: Uma Análise Bioinformática

Wang Cheng-Mei , Gang Luo, Ping Liu, Wei Ren, Sijin Yang

DOI: 10.36660/abc.20230674

Este Artigo Original é referido pelo Minieditorial "Desafios e Perspectivas dos Biomarcadores de Fibrose Cardíaca: Do Diagnóstico à Aplicação Clínica".

Resumo

Fundamento

A fibrose miocárdica (FM) ocorre durante o início e a progressão da doença cardiovascular, e o diagnóstico precoce da FM é benéfico para melhorar a função cardíaca, mas há uma falta de pesquisa sobre biomarcadores precoces da FM.

Objetivos

Utilizando técnicas de bioinformática, identificamos potenciais biomarcadores para FM.

Métodos

Os conjuntos de dados relacionados à FM foram obtidos do banco de dados Gene Expression Omnibus (GEO). Após o processamento dos dados, genes diferencialmente expressos foram rastreados. Genes diferencialmente expressos foram enriquecidos e, subsequentemente, interação proteína-proteína (PPI) foi realizado para analisar os genes diferenciais. Os miRNAs associados e fatores de transcrição foram previstos para esses genes centrais. Finalmente, a validação ROC foi realizada nos genes centrais para determinar sua especificidade e sensibilidade como potenciais biomarcadores. O nível de significância adotado foi de 5% (p < 0,05).

Resultados

Um total de 91 genes diferencialmente expressos foram identificados, e a análise PPI produziu 31 genes centrais. A análise de enriquecimento mostrou que apoptose, colágeno, matriz extracelular, adesão celular e inflamação estavam envolvidos na FM. Cento e quarenta e dois miRNAs potenciais foram identificados. Os fatores de transcrição JUN, NF-κB1, SP1, RELA, SRF e STAT3 foram enriquecidos na maioria dos alvos principais. Por fim, IL11, GADD45B, GDF5, NOX4, IGFBP3, ACTC1, MYOZ2 e ITGB8 tiveram maior precisão diagnóstica e sensibilidade na predição de FM com base na análise da curva ROC.

Conclusão

Oito genes, IL11, GADD45B, GDF5, NOX4, IGFBP3, ACTC1, MYOZ2 e ITGB8, podem servir como biomarcadores candidatos para FM. Processos como apoptose celular, síntese de proteína de colágeno, formação de matriz extracelular, adesão celular e inflamação estão implicados no desenvolvimento da FM.